立法院在2015年11月17日三讀通過由《所得稅法》第4條之1、第14條之2及第126條條文修正案，刪除《所得稅法》第4條之1證所稅的相關規定。自2016年1月1日起證券交易所得停止課徵所得稅。證券交易損失亦不得自所得額中減除，營利事業之證券交易所得則維持按所得基本稅額條例規定課徵基本稅額（亦即適用最低稅負制），證交稅徵收率仍維持3‰。
2016 新制上路（三）：證所稅走入歷史
2016 新制上路（一）：房地合一課徵所得稅
2016年，許多財稅、民生、投資、勞動法令新制上路。其中一項對營利事業或市井小民皆有重大影響的，便是房地合一課徵所得稅制度。
過去舊制下，僅就房屋部分計算財產交易所得課稅；土地部分，按公告土地現值所計算的土地漲幅課徵土地增值稅。然而土地現值與實價交易獲利存在相當差距，此外房地未合併課稅，也造成所有權人可能透過提高土地售價並壓低房屋售價，以規避房屋交易所得稅。
故自105年起實施房地合一課徵所得稅制度，房屋及土地出售時，應計算房屋、土地全部實際獲利，並減除已課徵土地增值稅的土地漲價總數額後，就餘額部分課徵所得稅。房屋、土地均需按實價計算交易所課徵所得稅。同時，輔以停徵不動產部分的特種貨物及勞務稅（奢侈稅）。