根據所得稅法規定，總機構在我國境內的營利事業，應就其境內外全部營利事業所得，合併課徵營利事業所得稅。營利事業所得之計算，以其年度收入總額減除各項成本費用、損失及稅捐後之純益額為所得額。

目前營利事業所得稅的起徵額為12萬，即全年課稅所得額在12萬元以下者，免徵營利事業所得稅。營利事業所得稅率原為17%，107年全民稅改後調高為20%。為了避免獲利不高的公司受衝擊，課稅所得額未超過50萬元之營利事業，採分年調整，107年度稅率為18%、108年度稅率為19%，109年度起按20%稅率課稅。

公司在申報營利事業所得稅時，不同的申報方式對於課稅所得額的計算、被稅局調帳的機率、盈虧互抵的權利等，都有差異。營利事業所得稅結算申報，主要有以下三種申報方式：擴大書面審核申報、查帳申報及會計師稅務簽證申報。

擴大書面審核申報

財政部為簡化稽徵作業，推行便民服務，訂定「擴大書面審核」的申報方式，

簡稱「擴大書審」。擴大書審的概念有些類似綜所稅採標準扣除額申報，並非減除實際的成本費用，而是以財政部訂的標準來減除成本費用，計算課稅所得額。財政部依照行業別所訂的「擴大書審純益率」，多介於4%至10%之間。

公司採「擴大書審」申報，課稅所得額計算公式為：

課稅所得額＝（全年營業收入淨額＋全年非營業收入）× 擴大書審純益率

擴大書審的適用條件及優缺點如下：

查帳申報

「擴大書審」是政府為簡化稽徵作業所推行便民措施，正常情況下，公司本應採「查帳申報」，核實課稅。公司應參照商業會計法等相關法令據實記載公司的收入、各項成本、費用及損失等，在辦理營利事業所得稅結算申報時，其帳載事項再依所得稅法等法令自行調整後，計算課稅所得額。

會計師稅務簽證申報

全年度營業收入與非營業收入達1億元以上的公司辦理營利事業所得稅結算申報，必須委託會計師查核簽證。除法令強制要求之外，公司選擇會計師稅務簽證申報通常有以下幾項原因：

1. 合法節稅規劃：一般公司對於稅務法規及租稅優惠不見得那麼熟悉，藉稅務簽證的機會，可請會計師規劃與指導，善用合法節稅的管道。
2. 盈虧互抵：若企業虧損時，採擴大書審申報可能導致虧損仍必須繳稅的結果；若採查帳申報，雖可核實課稅不必繳稅，但本年度的虧損在未來獲利時無法互抵；若採會計師稅務簽證申報，本年度的虧損可於未來10年內扣抵，即降低未來的所得稅負。
3. 交際費限額提高：為避免企業浮濫申報交際費，稅法對於交際費列支設有限額；採會計師稅務簽證申報時，交際費限額提高，可合法節稅，降低所得稅負。
4. 降低被查稅的風險：採會計師稅務簽證申報時，會計師必須出具查核簽證報告書，國稅局對會計師查核簽證報告書進行書面審核，公司被國稅局直接調帳查核機率較低，可降低被查稅的風險。
5. 降低查稅溝通成本：採會計師稅務簽證申報，若真的被稅局選中查核時，稅局會先找會計師調閱查核工作底稿，公司需直接面對稅局及提示帳證資料的機會較少，可減輕公司財會人員直接面對稅局的壓力。